方法论怀疑主义与“我思故我在”：他提出了系统的怀疑方法，试图通过质疑一切来找到不容置疑的真理。然而在这过程中，他发现唯一不能怀疑的是正在进行的思维活动本身，从而得出了著名的命题“我思故我在”（Cogito, ergo sum），即思考的行为证明了存在者的存在。"我思"成为了他哲学的第一原则，也是他认识论和形而上学的起点。这一观点强调了理性思维和自我意识的重要性，对后来的哲学家如康德产生了深远影响。

实体二元论：在他的形而上学中，笛卡尔区分了两种绝对不同的实体——精神和物质（或称心灵和身体）。精神的本质在于思想，而物质的本质在于广袤；二者彼此完全独立且互不派生。这种身心二元论的立场使得他在解释人类自由意志时认为，尽管我们生活在受物理定律支配的物质世界中，但我们的思想和意志是自由的，因为它们属于精神世界并遵循不同的规律。

天赋观念论：他认为人类心智中存在一些与生俱来的、清晰明白的观念或原则，这些天赋观念构成了知识的基础。例如数学原理和某些基本的道德准则，被他视为天赋观念的例子。

科学方法论与应用：作为一位杰出的数学家和自然科学家，笛卡尔将几何推理方法和演绎法应用于哲学领域，强调只有通过清晰明确的方法才能获得可靠的知识。他的这种科学方法论不仅影响了其后的哲学家也深刻改变了自然科学的面貌。此外他还积极倡导用科学方法来改善人类社会和政治制度以造福全人类